腹瀉病有感染性與非感染性之分，抗生素對于非感染性腹瀉沒有必要使用。

    當前臨床上正在推廣的《中國腹瀉病診斷治療方案》（簡稱方案）是1993年推出的，該方案改變了上世紀50年代建立起來的舊的腹瀉治療觀念如禁食、過多應用靜脈輸液、濫用抗菌藥物（抗生素、磺胺類等）等，樹立了新的治療觀念和方法，包括繼續飲食，應用口服補液鹽（預防脫水）糾正脫水，合理應用腸道粘膜保護劑，糾正濫用抗菌藥物等。至今3次修改都沒有動搖這一新的治療理念，正在醞釀的新的修改也不會動搖該理念，但該方案的推廣還有很多工作要做。

    對水樣便腹瀉應用腸道粘膜保護劑加口服補液鹽即可，應用抗生素不但沒有療效還會帶來很多不良反應，引起產生耐藥菌、菌群失調等多種危害，反而降低抵抗力，使腹瀉遷延不愈或繼發二重感染；而對于膿血便腹瀉，則應及時規范地應用抗生素治療；抗菌藥對飲食不當、氣候突變等原因引起的非感染性腹瀉當然無效。這也就是很多專家說的“腹瀉治療中70%不需用抗生素”的由來。

    專家表示，抗菌藥物尤其是廣譜抗生素的長期應用會導致腸道菌群紊亂，使腹瀉加重或不愈。所以須在診斷明確后，在醫生指導下合理、足量、規范 地使用抗生素。